Para poder conectar con un servidor en remoto, habitualmente se usa SSH. Uno de los mejores programas para Windows (ya que la consola de este sistema operativo no permite este tipo de conexion) es Putty.

Os dejo el link de descarga y un tutorial que os indicará como cofigurarlo para poder conectar remotamente a un servidor:

Descargar PuTTy

Tutorial de PuTTy